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解析:(1)业务(1)销项税额=1000×13%=130(万元)。(0.5分)
(2)无须缴纳增值税。(0.5分)
理由：将自产创新药销售后.提供给患者后续免费使用的相同创新药.不属于视同销售行为.不缴纳增值税。(1分)
(3)需要缴纳增值税。(0.5分)
理由：与销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产的收入或者数量直接挂钩的财政补贴收入.应计算缴纳增值税。(1分)
(4)业务(4)允许抵扣的进项税额=27+300×1%=30(万元)。(0.5分)
(5)无须代扣代缴增值税。(0.5分)
理由：纳税人提供技术转让、技术开发和与之相关的技术咨询、技术服务.合同报经省级科技和商务主管部门备案后，免征增值税。(1分)
(6)业务(6)应进行的进项税额转出金额=90÷(1-9%)×9%=8.9(万元)。(1分)
(7)业务(7)应缴纳进口环节增值税=100×3%=3(万元)。(1分)
(8)销售抗癌药品.可选择按照简易计税办法依照3%的征收率缴纳增值税。(0.5分)销售国产抗艾滋病病毒药物，免征增值税。(0.5分)
(9)无须缴纳增值税。(0.5分)
理由：对企业集团内之间的资金无偿借贷行为，免征增值税。(1分)
(10)进项税额可以抵扣。(0.5分)
理由：购入特许经销权属于其他权益性无形资产，不论用于什么项目，均可抵扣进项税额。(1分)
(11)销项税额=130+100×13%(业务3)=143(万元)。(0.5分)
允许抵扣的进项税额=30-8.9+1060÷(1+6%)×6%(业务9)=81.1(万元)(0.5分)
(12)一般计税方法应纳税额=143-81.1=61.9(万元)。(0.75分)
简易计税方法应纳税额=120×3%=3.6(万元)(0.75分)
(2)无须缴纳增值税。(0.5分)
理由：将自产创新药销售后.提供给患者后续免费使用的相同创新药.不属于视同销售行为.不缴纳增值税。(1分)
(3)需要缴纳增值税。(0.5分)
理由：与销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产的收入或者数量直接挂钩的财政补贴收入.应计算缴纳增值税。(1分)
(4)业务(4)允许抵扣的进项税额=27+300×1%=30(万元)。(0.5分)
(5)无须代扣代缴增值税。(0.5分)
理由：纳税人提供技术转让、技术开发和与之相关的技术咨询、技术服务.合同报经省级科技和商务主管部门备案后，免征增值税。(1分)
(6)业务(6)应进行的进项税额转出金额=90÷(1-9%)×9%=8.9(万元)。(1分)
(7)业务(7)应缴纳进口环节增值税=100×3%=3(万元)。(1分)
(8)销售抗癌药品.可选择按照简易计税办法依照3%的征收率缴纳增值税。(0.5分)销售国产抗艾滋病病毒药物，免征增值税。(0.5分)
(9)无须缴纳增值税。(0.5分)
理由：对企业集团内之间的资金无偿借贷行为，免征增值税。(1分)
(10)进项税额可以抵扣。(0.5分)
理由：购入特许经销权属于其他权益性无形资产，不论用于什么项目，均可抵扣进项税额。(1分)
(11)销项税额=130+100×13%(业务3)=143(万元)。(0.5分)
允许抵扣的进项税额=30-8.9+1060÷(1+6%)×6%(业务9)=81.1(万元)(0.5分)
(12)一般计税方法应纳税额=143-81.1=61.9(万元)。(0.75分)
简易计税方法应纳税额=120×3%=3.6(万元)(0.75分)
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